Siyasette ilk olarak Milliyetçi Hareket Partisi (MHP) saflarında aktif rol alan Güner, Alparslan Türkeş'in "A takımı" içerisinde yer aldı. 12 Eylül öncesinde MHP'nin önde gelen isimlerinden biri olarak dikkat çekti. "MHP ve Ülkücü Kuruluşlar Davası" kapsamında tutuklanan Güner, 16 ay cezaevinde kaldıktan sonra ilk duruşmada tahliye edildi.
TBMM'de 16. Dönem Konya, 20. Dönem Ankara ve 21. Dönem Balıkesir Milletvekilliği yapan Güner, parlamentodaki çalışmalarıyla tanındı. 1977-78 yıllarında Süleyman Demirel'in başbakanlığındaki 41. Hükümet'te Ticaret Bakanı, 1996'da Mesut Yılmaz'ın başkanlığındaki 53. Hükümet'te ise Kültür ve Turizm Bakanı olarak görev yaptı.
                            

Güner, Devlet Planlama Teşkilatı'nda uzmanlık, Ankara Ticaret Odası Genel Sekreterliği, Millî Prodüktivite Merkezi Başkan Yardımcılığı, Ticaret Bakanlığı Müsteşarlığı ve Ankara İktisadî ve Ticarî İlimler Akademisi öğretim üyeliği gibi birçok önemli görevde bulundu. Ayrıca Avrupa Konseyi Parlamentosu Bütçe Komisyonu Başkanlığı da yaptı.
ANAP'ta Genel Başkan Yardımcılığı görevinde bulunan Güner, daha sonra DYP saflarına geçti. Tansu Çiller döneminde partiye katılan Güner, siyasi yolculuğuna burada devam etti.

Aile hayatı ve son yılları

Evli ve beş çocuk babası olan Agâh Oktay Güner, siyasi çalışmalarının yanı sıra yazar ve hatip kimliğiyle de biliniyordu.
Gazetelerde köşe yazıları yazan Güner, son yıllarında ise daha sakin ve içine kapanık bir yaşam sürdü. Ancak okumaya ve fikir üretmeye olan ilgisini hayatının son dönemine kadar devam ettirdi.